Hola Javier.
Recuerda que para tener dos circuitos independientes, uno debe estar aislado del otro, tanto en los dos railes como en el carril central.
Cada uno de los circuitos, deberá alimentarse con un transformador independiente.
En el Toporama Trens 1003, creo que los mejores puntos de aislamiento serian en los dos puntos que te marco en rojo de una foto que he sacado de la Web.
Adjunto:
Toporama copia.jpg [ 71.4 KiB | Visto 4424 veces ]
Como es lógico, cada circuito se alimentaría con su correspondiente vía de alimentación.
Las vías interrumpidas, las usarias para la instalación de semáforos y cortes de alimentación a vías muertas, por ejemplo.
Espero haberte ayudado, si no pon una foto del tapiz o el esquema para diseñar los cortes y aislamientos.
Un saludo